長期以來，我國農業(yè)生產屬于傳統家庭式小農經濟，以規(guī)模小、品類單一為典型特點，而超市則以批量大、品種多為需求特征，在“農超對接”過程中，一方面需要由農業(yè)合作組織作為代理人幫助組織農戶產品進入“農超對接”的供應鏈系統中，同時要盡量保證所提供的產品符合超市的要求，包括規(guī)格、質量及新鮮程度等；另一方面也需要超市在產品采購、定價等方面給予保證，并承擔農產品歉收、價格波動等風險。因此在“農超對接”實際運營中，雖然取得很大成效，但是總體上仍處于‘‘雷聲大雨點小”階段，其中的主要問題如下；

      1．缺乏宏觀政策扶持措施由于我國農業(yè)合作組織規(guī)模比較小，實力較弱，而且偏重于生產型合作，對組織農產品進入市場、實現終端銷售較為滯后，在與超市談判過程中處于弱勢地位，因此亟需國家出臺相關政策，對農業(yè)合作組織的發(fā)展、管理及運作規(guī)范予以明確規(guī)定，并在資金、技術等方面給予扶持，使其具備初級加工、包裝及運輸等功能，提高與超市的對接程度；而超市在“農超對接”中扮演著連接農戶與市場的重要角色，在接收農產品及定價等方面具有決定權，同時又需要完成檢測及配送等方面功能，因此國家應對超市給予政策支持，包括對建設配送中心、冷鏈物流等加大補貼力度，調動超市的積極性。

      2．缺乏法律規(guī)制相關利益主體行為

      在實施“農超對接”過程中，牽涉利益主體較多，主要包括農戶、農業(yè)合作組織i超市等，各方在談判過程中所處的地位存在較大差異，而且由于農業(yè)生產具有一定的周期性和波動性，農民與超市簽訂銷售合同的時間往往在前，而實際產品上市在后，這其中存在很大的不確定性，包括因自然原因造成的產量減少、質量下降，或者同期上市產品數量集中或稀缺，導致超市壓價或農民惜售等多種問題，需要有相關法律明確利益主體的權責，規(guī)范利益主體的市場行為，同時對違規(guī)、欺詐行為進行懲處，減少利益相關主體在合同簽訂和執(zhí)行過程中的摩擦，降低溝通成本，提高彼此信任程度，改進“農超對接’執(zhí)行效率。

      3．農產品質量檢測體系不健全

      農產品生產具有明顯的季節(jié)性、分散性，而且受氣候等自然條件影響較大，產量不穩(wěn)定，品質差異明顯，同時由于農業(yè)合作組織受資金、資質所限，對農產品缺乏質量安全監(jiān)測，導致農產品在進入超市過程中面臨諸多障礙，包括農產品規(guī)格、標準不符合超市上架要求，產品質量檢測不達標等。其原因一方面是我國農產品尚未實行標準化分級制度，農民對質量規(guī)格認知程度較低，在生產過程中對產品規(guī)格、品相未給予應有重視；另一方面缺乏健全的農產品質量監(jiān)測制度，在鄉(xiāng)鎮(zhèn)一級缺乏具有公益性質的為農產品上市進行質量檢測的專門機構，農產品的質量檢驗程序復雜、費用較高，使普通農戶產品無力進行安全檢驗，導致其在進入超市過程中面臨極大不確定性。

      4．基礎設施信息化水平滯后

      近年來，信息技術發(fā)展迅速，但是流通基礎設施信息化發(fā)展剛剛起步，信息平臺建設尚處于初級階段，不僅提供的信息量和內容不到位，難以及時發(fā)布農產品產銷信息，而且覆蓋范圍有限，尤其在偏遠的農業(yè)產區(qū)，大部分農民只能通過收購者或批發(fā)市場獲得市場需求信息，帶有很大的盲目性，經常導致出現“賣難”或者某類農產品過剩等情況；超市采購也往往需要通過中間商來獲知農民生產種植情況，增加了搜尋成本，一定程度上阻礙了“農超對接”的發(fā)展。